新华宫，东亚联合大本营。
北京时间1月4日上午，大本营海军部长暨海军参谋长严复上将就林加延海战的战果与战损情况向大本营最高统帅联席会议呈报。
南海方面舰队各参战单位在1月1日到2日林加延湾周边的作战中，共确认击沉敌战舰4艘（其中无畏型2艘）、战列巡洋舰1艘、装甲巡洋舰4艘、轻巡洋舰7艘、驱逐舰和鱼雷艇14艘。重创敌战舰2艘、装甲巡洋舰和轻巡洋舰4到6艘、驱逐舰和鱼雷艇6到7艘。俘虏敌落水官兵957名。
我方当日的损失为：总共8艘轻巡洋舰、9艘驱逐舰、1艘潜舰和35艘鱼雷艇战沉或重伤报废，36架各式飞机（包括33架重轰炸机）战损、失踪或降落后报废。阵亡失踪796人，战伤582人。
此外，在新加坡港外设伏的潜舰部队至1月3日确认的战果为：击沉敌大型防护巡洋舰2艘，装甲巡洋舰1艘。击伤敌战舰2艘（其中无畏型1艘）。
听罢报告，日本海军驻联合大本营代表东乡平八郎大将不满道：“南海方面主力部队未能把握有利时机，迅果断全歼敌联合舰队残部，马司令官难辞其咎。”
严复辩解道：“天气情况和战场态势不利，为避免陷入混战遭致重大损失而暂时脱离接触，我认为是可以理解的。南海方面舰队的旧式战舰防护相对薄弱，与敌新锐战舰混战必然大为不利，即便能在混战中全歼敌舰，付出的代价也将十分沉重，杀敌一千、自损八百的胜利是不合我军战争指导方针的。”
“我以为，即便以南海方面舰队全部之牺牲，换取敌联合舰队之全灭，亦可称大胜。军人岂可临阵畏战！见敌必击，难道不是海军最核心之信念吗？”
“那不过是英国人的卤莽信念，我东亚海军自应有我东亚人之信念，数千年浸染之智谋韬晦，虚实之理，隐忍心性，岂可以‘见敌必击’四字掩而概之？”
列席会议的国防总部海军部长林泰曾大将抬手道：“好了好了，马司令官想必确有其难处，然而未能全歼敌联合舰队，实属遗憾，其指挥不当之处，却是瑕不掩玉，就留给后世慢慢评判去吧。经此一战，南海方面敌舰队在一两个月内已无法对我构成实质威胁，而东海方面第二机动部队两天后即抵达高雄基地，以几乎无损之南海方面舰队主力加上第二机动部队之新锐战舰，握控南海制海权，协同6军横扫南洋，必当易如反掌。那么，南海方面接下来的作战，不知6军有何打算？”
大本营6军部长暨6军参谋长（兼国防总部6军部长）王直大将点头道：“我们打算加快菲律宾方面作战进度，除了尽快恢复在林加延湾和苏比克湾的滩头补给外，预定以第54军在吕宋岛东南拉蒙湾登6，以收三面合击之效。以作为第七集团军预备队之115师在棉兰老岛达沃湾登6，以求迅控制吕宋以南诸岛。为此，希望海军为上述登6作战提供充分支援。”